既然昆达里尼的启动有可能引发较重的不适感，那么，启动它是否是危险的呢？
昆达里尼本身没有危险，也对人体没有害。之所以感到不适的部分是由于能量阻止限制了昆达里尼的流动。这样一来就会产生痛苦，恐怖甚至危险的体验。
蓝星上有很多专门解释昆达里尼启动之后引发不适原因的书籍。其中《tantra: path of Ecstasy》里面说明：
「没有清理脉流系统nādi system（编按：Nādi是让生命能量流动和运输的管道）就让那蛇能量（昆达里尼的原始阴性之力）沿着中轴而上是不可能且危险的尝试。取而代之，它可能会不会进入中央管道（中脉sushumnā-nādi），而是被迫进入中央管道旁任何一边、即左脉（idā-nādi）或者右脉（pingalā-nādi）。这会导致身体和心智的巨大混乱。」
「每个器官里都有可怕的骚动，这令人震惊和痛苦。身体的每个部位都像是在烈焰中燃烧。」
这就是说，若昆达里尼过早地、以不正确的方式受到刺激或唤醒（例如在准备和能量体清理不足的情况下），便可能引发较为严重的不适感。这一切都因为昆达里尼是极强劲的动力。
有时候，蓝星人类也会把昆达里尼启动和灵性觉醒混淆在一起。
事实上，两者听起来一样，但本质上稍有不同。
灵性觉醒过程（或灵性扬升）倾向于情绪和心理层面。灵性觉醒通常是由脑和心主导的。灵性觉醒时更多的是灵性特质，包括深层质疑、洞察、以及神圣的变貌（有人将其称为灵性炼金术）。
启动昆达里尼则反过来，昆达里尼在身体层面被感知；它是活力的能量：可能缓慢而渐进、或突然而强烈的涌动。虽然昆达里尼的启动通常是人在经历过灵性觉醒后才发生，但并非总是如此。有时候昆达里尼可能在使用一些药品后、亲密关系，甚至创伤情况下突然出现。昆达里尼启动时体内可能会感觉到强烈的振动和热；
当灵性觉醒和昆达里尼同时发生的时候，两者都容易导致灵魂暗夜。
除此之外，昆达里尼启动的时候要注意一些隐藏的陷阱。
包括以下的陷阱：
灵性傲慢–视自己比他人「更清醒」，鄙视那些不那么向前或仍「沉睡」的人（也称为灵性小我）
救世主情结–带有过分自我夸耀和独特感，相信自己是被送来「拯救世界」的人。
嫉妒和依附–当那些昆达里尼启动带来的幸福经历地丢失时，他会拼命地捉住它，而且感到悲剧（甚至不惜进入危机模式）。
灵性虚无–把宇宙真理误用到人类层面，例如「一切都是幻觉」、「到最后没有任何事是重要的」，孕育出抽离、空虚和犬儒主义。
逃避–逃避或走灵性捷径，绕过日常职责、仅关注「高层的灵性事务」（本质上，这是自我在逃避成长和整合经验的方式，在人性的层次上）
为了避免这些陷阱，我们需要：
1.温和对待自己，照顾好自己的神经系统。因为神经系统容易在这个过程中过劳。所以，尽量采取一些让神经系统放松的方法。
比如：
用薰衣草等精油浸浴。
找到那些能够让自己觉得有安全感的物件\/人、宠物。可以时常拥抱。拥抱这些小动物，或者你的伴侣，朋友。
来到大自然中的某个角落，让自己和盖亚女神更加亲近。饮食上更加接地（接地的食物）。
家中的某个角落，在这里你可以感到舒适，放松。聆听平静的音乐。调整自己的呼吸方式。
2.休息。
当灵性觉醒时，昆达里尼的能量会更加强大，让自己尽可能停下来，让自己休息。
3.寻求专业人士的帮助。