京师之中，悄然多出了一座建筑，名为忠烈祠，是朱由检特命工部建造的，里面供奉着此次大战中战死将士的牌位。
外有礼兵站岗，其内香烟袅袅，香火不断。
京中百姓，也多有感念，不少人纷纷进入上香。
一些在战场伤退的士兵，被安置在此，负责打理忠烈祠，礼部也派专人看护。
皇明时报也大肆宣传报道，说书先生，也在各个茶楼酒肆，绘声绘色的讲述。
在朱由检的支持下，大明格物院也正式成立，由工部尚书徐光启担任掌院学士，一大批精于技术的人应邀进入格物院，负责科技研发。
像宋应星，王徽等人，赫然在内。
尤其是王徽，据说蒸汽机就是他发明的，而且还掌握了包括万有引力在内的力学原理。
至于，西方掌握的那些科技，不少观点都认为是从明朝偷过去的，还有的则是认为，是满清勾结西洋传教士，联手抹杀明朝的科技。
但由于满清入关之后，销毁了太多的关于明朝的资料了。
尤其是某个臭不要脸的，以编纂四库全书为名，大规模的销毁民间藏书，有关明朝的书籍资料，更是无法幸免。
这就导致，明朝的很多事情，难以了解。
就像扬州十日，清军残酷屠戮数十万扬州百姓，这种罄竹难书的事情，九州大地上竟然找不出一个字的记载，最后还是在日本发现并被爱国人士传回国内的。
可悲，可叹。
更可恨！
成立格物院的同时，朱由检也对军事机构进行了调整，成立了参谋部，兵部职方司并入参谋部，兵部尚书李邦华担任总长，陈奇瑜担任次长。
同时，对北直隶的卫所进行裁撤，卫所土地，全部划为皇庄，交由户部农业司管理。
卫所人员，愿意从军的，从中挑选青壮入军，其余人转为民籍，分配土地和安置费。
但最让朱由检头疼的，还是卫所那些世袭的军官。
有人说，朱元璋对待功臣刻薄寡恩，其实也不尽然，朱元璋针对的只是最上层的那部分。
而且，朱元璋大规模的清理功臣，是在洪武二十五年，太子朱标去世以后才开始的。
而且，这些人不少本身就不干净，并不算冤。最典型，就是蓝玉，玷污蒙元王妃，派兵攻打自家关隘，若不是因为朱标，蓝玉早就死了不知道多少回了。
其他人中下层的功臣，老朱还是对得起他们的。比如，卫所的指挥使，指挥同知，指挥佥事，千户，百户，不少都是世袭的，从祖上一辈一辈传下来的。
就像大名鼎鼎的戚继光，其先祖戚祥，本是朱元璋的亲兵，后随傅友德攻取云南时不幸战死，朱元璋就恩赐其后人世袭正四品的明威将军。
对于这些人，朱由检便提出，愿意退出军籍的，则从优安置，还愿意在军中的，选拔合格之后，分配至军中。
至于又没本事还不舍得官位的，朱由检则是直接成立了一个军官营，让他们全部进入军官营，按照最严格的标准训练。
同时，让史可法担任军官营的主将兼教导官。
这一招很有效，在史可法那近乎圣人般的军规军纪下，这些人主动提出，不要了，什么都不要了，只要能让我们回家，倒给钱都行。
最终，军官营成功且圆满的完成了他的历史使命，史可法还是返回原岗位，继续担任他的军法处长。
军中也招募补充了新兵，而南方的勤王军队，也已经陆续到达京师，此时，也正和新兵一起，参加整训。
其中，最让朱由检惊喜的是南直隶派来的军队，孝陵卫。
孝陵，明太祖朱元璋的陵墓，孝陵卫，顾名思义，就是孝陵的戍部队。
孝陵卫的士兵，挑选极其严格，其中，最精锐的有五百人，其选拔标准是，能骑马扬鞭，飞速奔驰，骑马能跨过一道壕沟，越过一堵墙，并在马上开弓射箭，三箭射中两箭者，才为合格，而且实行末位淘汰制。
直至南明弘光元年，清军逼近南南京，弘光帝出逃后，孝陵卫在清军入南京的时候，拒绝投降，末代明孝陵卫指挥使梅春率部起兵于孝陵卫，兵败后仅剩十八人退到孝陵卫死守，最终以十八人全部阵亡的代价消灭清军三百人。孝陵卫军户董某、赵某等因年老体弱无法上战场抗清杀敌，在听到明孝陵失守的消息后，带着妻女上吊自杀。
何其壮哉。
此时，朱由检正在乾清宫，亲自接见孝陵卫指挥使梅春。
“梅指挥使，孝陵卫目前有多少人？”
“回禀陛下，孝陵卫目前还有两千一百二十五人，这次末将带一千五百人进京勤王，其余的，则是继续护陵。”
朱由检暗暗思索，天下赋税，半出江南，同样，那里也是文人士大夫的聚集地，东林党的大本营。
“一个卫标准人数是五千六百人，缺的人，朕给你补齐，朕不光给你补齐，而且还给你补至一万人。”
“你要做的，就是当好我大明在江南的定海神针。”
“朕还特意挑选了一人，前去协助你。”
话音刚落，乾清宫内走进来一人，正是刘之纶。
朱由检指向刘之纶介绍道：“这是刘之纶，崇祯元年的进士，投笔从戎已经三年了，前不久也是参加了对建奴的作战，如今伤愈归队。从今日起，他就担任孝陵卫的教导官。”
“不过你也不用担心，他这个教导官，就是教导士兵忠君报国，督导士兵训练的，军事方面，还是以你为主。”
“你呢，也可以理解为是一种变相的监军。”
对于朱由检这种大实话，梅春还有点不适应，不过，普天之下，莫非王土，率土之滨，莫非王臣，就算是直接派监军，那也是应该的。
“陛下说笑了，有进士老爷能在孝陵卫中任职，我们求之不得呀。”
刘之纶也很上道，朝着梅春一抱拳，“梅指挥使，今后还请您多多关照。”
“哪里，哪里，咱们都是为陛下办事。”
就在这时，礼部尚书来宗道求见，梅春和刘之纶则是很识趣的告退。