在暂时解决了粮食危机的问题后，刘博源总算是可以好好的轻松一回。
可是这种陪着媳妇儿与孩子的日子没过多久，一封来自于长城外格日勒的传信，打破了这种轻松的生活。
皇太极登基称帝了。
崇祯九年四月五日，满洲诸贝勒、外藩蒙古诸贝勒、汉军都元帅、总兵官等齐聚盛京，举行盛大典礼，共上皇太极尊号为‘宽温仁圣皇帝’。
四月十一日，皇太极正式即位称帝，定都盛京，改女真族为‘满洲’，以掩盖曾经臣服于大明的历史；改国号为‘大清’，改元‘崇德’，以示其夺取中原，取代大明的决心。
皇太极在称帝后，立即下令境内所有汉民，皆剃发易服，形如满式。如有不从者，将斩首立威。
刘博源知道，皇太极在称帝后不久，就开始紧锣密鼓的策划入寇大明之事。
而且入寇大明的时间，就在今年的六月及七月。
果不其然，在刘博源焦急的等了近半个月的时间后，终于从宣府镇传来清军入寇的消息。
六月二十七日，清武英郡王阿济格，偕同贝勒阿巴泰、扬古利，统领满蒙各五万兵马，兵分三路从镇安、青泉、赵川寇关而入。
大军浩浩荡荡而来，经由保安卫、怀来卫境内，最后在延庆州停留下来，等待着另一路从喜峰口寇关而入的清军。
一时间，宣府镇各地烽火四起，明军无力抵抗，百姓惨遭清军毒手，犹如地狱。
七月三日，崇祯皇帝宣布京师戒严，并针对清军自宣府、大同入寇的进军路线，命宦官李国辅守紫荆关，许进忠守倒马关，张元亨守龙泉关，崔良守固关。
在得知清军入居庸关，围攻昌平的消息后，崇祯皇帝又命张元佐为兵部侍郎，镇守昌平，并遣司礼监宦官魏国征守卫帝陵天寿山。
与此同时，兵部传檄各地总兵，火速领兵入卫。
七月十日，山东总兵刘泽清领兵五千，山西总兵猛如虎、王忠领兵四千，山永总兵祖大寿领兵五千，大同总兵王朴领兵五千，保定总兵董用文领兵五千，关、宁、蓟、密各总兵祖大乐、李重镇、马如龙共领兵一万七千入卫。
......
十万清军入寇，对于隔着千里之遥的延绥镇来说，还是没有受到多大的影响。
可刘博源却是有着一股强烈的居安思危的心理。
虽然说在后面的几次清军入寇，延绥镇都没有受到清军的袭扰。
但保不齐长城外的鞑靼人会袭扰延绥镇。
要知道，草原上的察哈尔部落，与刘博源可是有着不小的仇恨。
而且如今草原上的鞑靼人，已经全都臣服于大清。
没有了外敌的鞑靼人，势必会再度袭扰各边地。
因此，刘博源还是要做好随时应对草原上敌人的准备。
七月十五日，刘博源命乌拉达及特鲁苏，让二人将部落迁徙到了威武军绿洲，也就是曾经的乌喇特绿洲。
同时，刘博源还交给二人一个任务，时刻监视来自于毛乌素沙漠的北面的敌人。
毕竟是刘博源帮助二人重新当上了部落首领，心中自是感激万分。
对于刘博源交代的任务，二人拍着胸脯保证，一定会做好预警外敌入侵的放哨任务。
做好了防备北面敌人的预警工作后，刘博源又重新将注意力，放到了清军入寇的事情上。
七月二十日。
清军统帅阿济格采取避实就虚的战术，连克昌平、定兴、房山，昌平总兵巢丕昌降清。
随后，阿济格又放火焚烧明熹宗的德陵。
崇祯皇帝听闻自己皇兄的陵寝被清军焚烧，当即失声痛哭，并急召群臣，商讨攻防之策。
一向才鄙而怯、巧于趋利避患的兵部尚书张凤翼，只得自请总督各镇援兵出师，与宣大总督互为犄角。
崇祯皇帝大喜，立即同意他的请求，并赐尚方宝剑，给赏功牌五百个，令监理关宁太监高起潜为总监，总兵祖大乐为提督，与山海关总兵张时杰皆属高起潜指挥。
可是，明军在面对气势汹汹而来的清军，根本不敢与之对战，而是全都据城而守，不敢出城。
清军如入无人之境，大肆的在京师附近烧杀抢掠。
崇祯皇帝见形势不见好转，遂急调正在郧西剿贼的卢象升领军入援，并升任卢象升为兵部左侍郎，总督宣大、山西军务，赐尚方宝剑，以加强山西、宣大的防御。
......
随着清军的入关，大肆的在宣府、蓟州劫掠，远在陕南的高迎祥等流贼，却迎来了官军的毁灭式打击。
崇祯九年七月中旬，高迎祥等流贼见汉中有官军重兵把守，无法通过栈道北上，于是决定从汉中东边的石泉山北出子午谷，进入西安府。
率领官军追剿的孙传庭，对此早有预料，派驻重兵控扼西安西面的黑水峪出口。
七月十六日，高迎祥等流贼进入盩厔南的黑水峪，随后与控扼出口的孙传庭展开四天的激战。
流贼初战告捷，击败参将李遇春所部官军。
尾随追来的洪承畴见势不妙，遂施展招降流贼的方法，分化流贼。
高迎祥手下的千公鸡张二、一斗谷黄龙等人私下向官军贺人龙接洽投降。
七月十八日。
双方在马召原再次展开激战。
在激战过程中，叛变的张二与黄龙等人利用雨后大雾，趁高迎祥下马张弓射箭之时，偷偷的把高迎祥的坐骑和麾下部卒向南拉走。
等到高迎祥发现之后，已是来不及了。
于是，高迎祥只得脱下甲胄，躲进草丛，但却不幸被官军俘获。
七月二十一日，洪承畴与孙传庭向崇祯皇帝报捷。
崇祯皇帝大喜过望，急令二人将高迎祥押解至京师。
高迎祥的被俘，可以说是对流贼一个重大的打击。
有一些流贼首领因此感到前途悲观失望，便走向了乞降的道路。
如有流贼首领张妙手、蝎子块拓养坤分别向孙传庭乞求招安。
但是，仍有张献忠等流贼，依旧在与官军作着斗争。
七月二十六日，在高迎祥被俘后，张献忠等流贼急忙向着河南逃窜，躲避洪承畴及孙传庭的围剿。