龙军根据目击证人提供的线索，提取了谋杀现场轮胎痕迹的石膏模型，该车的轮胎组合非常特殊，龙军根据江口镇上经销商的销售记录迅速锁定了桑塔纳车主身份。
但是，对桑塔纳车主进行调查后发现，桑塔纳车主在慕容晓薇失踪遇害的那段时间，他和几个朋友都在车上，与此案并无关系，因此桑塔纳车主的嫌疑被排除。
龙军对慕容晓琳和莫丽丽询问时，他们也提到了吕姓证人提到的那名男子。
案发当晚，那名男子并不是第一天在马路对面徘徊，而且他还曾进礼品店看过礼品，他看了很长时间却什么也没有买，因此对他的印象很深。
莫丽丽回忆：“那位男子高高瘦瘦，黑色头发，穿着黑色皮克。”
莫丽丽的回忆同吕姓目击证人的描述十分吻合，这是一条很有价值的侦破线索。
在慕容晓薇的葬礼上，龙军和周卫东在慕容家不远处观察，因为犯罪嫌疑人参加受害者葬礼的并不少见。
但是，龙军和周卫东只看到慕容晓薇的家人和朋友，以及她工作学校里的同事和学生们，并没有发现任何可疑的人。
由于犯罪嫌疑人迟迟没有落网。整个江口镇悄然发生了变化，晚上出门的居民变少了，女性的防身课程成为热门，有女孩的家庭变得谨慎小心，会派人接送她们上下班。
小镇似乎有点人心惶惶，唯恐犯罪嫌疑人再度作案，每个人都是提心吊胆过日子，好像都被慕容晓薇被杀事件吓坏了。
龙军认为大部分凶案的凶手是被害者所认识的人，因此他让调查小组重点调查慕容晓薇的男性同事和亲友。
慕容晓薇的男朋友靳卫东列入了调查对象。靳卫东告诉龙军案发当晚他在母亲家，尽管他的母亲证实了这一点，但是龙军还是扣押了他的车，并对其进行了长时间的调查和审问，法医还提取了他的dNA样本。
靳卫东的好友项布对龙军说：“靳卫东对慕容晓薇很好，没有对她有过暴力倾向，而且自从慕容晓薇失踪后，他一直在努力寻找，他怎么会杀害女友呢？”
龙军在调查靳卫东的嫌疑时，他的dNA样本被送往东海省警厅检测，在dNA比对结果出来后，靳卫东的嫌疑被排除。
案件继续查下去，调查小组接到了越来越多捕风捉影的电话，在短短的时间里被记录的名字就超过了五百多人，大量无用的信息消耗了本来就很紧张的警力。
武都警局为了不遗漏任何线索，又能减少调查小组的负担，便用提取dNA的方式来减少名单上的人数。
但当时提取dNA的方式为侵入式，也就是需要提取血样，并不是所有嫌疑人都愿意这么做，他们有着各种各样的担扰，另外他们有各种拒绝的理由。
当年的dNA在刑事诉讼中的应用还处于起步阶段，武都警局一方面向愿意提供血液样本的嫌疑人提取样本，另一方面对拒绝提供血液的嫌疑人进行排查。
调查小组的工作相当缓慢，随着时间的推移，调查小组陆续有人调走或另有任务，办案的刑侦员不断减少。
后来，龙军退出调查小组后，案件的调查便中断了下来。渐渐地，慕容晓薇被害案成了一桩悬了二十多年的冷案。