《明太祖实录》一共修改过三次。
第一次，一修于建文元年（1399年）。
人员：董伦、王景彰……
第二次，二修于永乐年初。
人员：李景隆、茹瑺、解缙……
第三次，三修于永乐九年（1411年）。
人员：姚广孝、夏原吉，胡广……
由于明成祖多次修改《明太祖实录》，因此真实性存疑，学界公认。
1《明史》记载：马皇后有七个亲生孩子，分别为生五子二女。
——长子太子朱标，次子秦王朱樉，三子晋王朱棡，四子明成祖朱棣，五子周王朱橚；女儿宁国公主、女儿安庆公主。
相关史料：
《明太祖实录》、《明史》、《奉天靖难记》、《天潢玉牒》认为马皇后为朱元璋生下五子二女。
《奉天靖难记》记载马皇后有朱标、朱樉、朱棡、朱橚、朱棣五个孩子，太子朱标德行有失，忤逆太祖朱元璋意，欲图谋反，弑父弑母。
《明太宗实录》→周王曰：“奸恶屠戮我兄弟,赖大兄救我,今日相见,真再生也。”
大兄=朱棣
矛盾→《太宗实录》，诸王称朱棣为大兄。
2马皇后无子。淑妃李氏生了长子太子朱标（可能性小），次子秦王朱樉，三子晋王朱棡。碽妃生明成祖朱棣。孙贵妃生五子周王朱橚。
相关史料：
《南京太常寺志》
大报恩寺牌位
《国榷》
3马皇后或李淑妃生长子太子朱标，次子秦王朱樉，三子晋王朱棡。碽妃和孙贵妃生四子明成祖朱棣，五子周王朱橚。
相关研究者：明史研究奠基人，吴晗先生。
中国人民大学历史系教授，毛佩琦老师。
中国明史学会会长，商传先生。
观点1：朱棣和周王朱橚是亲兄弟，非马皇后生。
观点2：明史学会会长，商传先生认为马皇后无生育能力，可能是战争时期，身体受到严重亏空。
4马皇后生四子明成祖朱棣，五子周王朱橚。
《国史异考》：“按今玉牒云：第四子今上，第五子周王，高后所生也。”
郎瑛《七修类稿》：“高后生二子，出今鲁府玉牒。”
＊
《太祖成母孙贵妃传》记载周王为庶子。《明史·黄子澄传》记载“周王，燕王之母弟。”同母亲弟。
《永乐实录》记载周王和明成祖是同母兄弟，故朱棣也是庶子。
《永乐实录》记载明成祖是马皇后生。
同一本书，记载自相矛盾。
《南京太常寺》为何记载朱棣母亲为?妃？
为什么修建大报恩寺，供奉碽妃？
无从得知。
孝陵供奉神位的位置：左一李淑妃，淑妃生太子朱标、秦王、晋王，右一位碽妃，生成祖朱棣。
其他相关资料
《三垣笔记》
《国史异考》
《明史》
《明清史讲义》
《明史考证》
《明成祖传》
《明成祖大传》
《朱棣篡史论述》
……
结论：其实还是朱棣自己整的事。
明成祖朱棣太爱改史，可以确定明成祖朱棣是朱元璋亲儿子。
至于后续，不再讨论这个史学界各执一词的问题。
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