诸葛亮放走孟获的决定，虽然有些将士们心中有些无法理解、心中不悦，但是蜀军将士都无不遵从和拥护丞相的决策。
这是诸葛亮第一次掌军，居然能达到如此的威望。
诸葛亮自从跟随刘备以来，一共已经过去20年的时间了。诸葛亮也跟随刘备，经历过无数次大大小小的战役。而诸葛亮自己作为三军主帅率军出战的，此次南征才是第一次。从此之后，蜀汉的军权就牢牢地把握在诸葛亮手中。
南征对整个蜀汉的意义也是非凡的，这是蜀汉政权正式建立以来的第二次大规模用兵。第一次是刘备东征孙权，那次对外战争打光了蜀汉集团大部分的军事力量和军事人才储备。
在经历短短的二年的时间，诸葛亮除了在经济民生建设上花了大精力，重用了像蒋琬、费祎、陈廷、马谡等的治国理政的贤臣，恢复民生，发展国力。
同时，在军事上的发展，也是未敢停歇。设置了成都、江州、汉中、永安等军区，招募、训练新兵，并提拔重用了一些新生代的将领。
将张苞、关兴作为张飞、关羽的接班人来培养，这两位二代将军也是不负众望，展现出来强大的军事素养，在东征期间也有着不俗的表现。另外，像向宠、胡济、邓芝、马岱，也都加入了将领培养梯队。
然而，刘备当年托孤的大臣有两位，一位是“荆州派”的领袖诸葛亮，身兼丞相和益州牧，主管蜀汉政务，辅佐皇帝总理百政。另外一位，托孤之臣便是“东州派”的领袖李严。
东汉末年，天下大乱，皇室宗亲刘焉为避中原之祸，放弃朝廷高位主动要求前往偏远的益州当州牧，带着一干早已物色好的心腹去益州赴任。
刘焉入主益州时，益州本土地方势力非常强大，刘焉势单力薄，无法驾驭当地的土豪士族。为弹压益州地方势力，刘焉以入蜀带来的人才为基础组建了东州派，同时收编招募进入益州的南阳、三辅一带流民，编练成数万人的“东州兵”。吴懿、法正、李严、孟达这些都是东州派的骨干力量。而现在李严就成了东州派的领袖了。
刘备让李严和诸葛亮共同辅政，诸葛亮为正，李严为副。让李严任尚书令兼任中都护（位同大都督），职责是“统内外军事”。
所以，按道理职责来说，刘备的设计是军、政分离，诸葛亮总摄政府百官，而李严才是蜀汉军权的一号人物。怎么蜀汉军权都落在了丞相的手里。
首先，就将领而言，元老派系的如赵云、廖化与诸葛亮相处时间久，互相信任，达成了良好的合作默契；而如魏延、杨仪等属于荆州派的将领也不用多说；益州本土派的马忠、王平等也多是诸葛亮的提拔。
其次，诸葛亮兼任了益州牧。蜀汉只有一州之地，是天下九州中最大的益州。作为益州的最高长官，?益州牧的职责包括总理益州的治安、?民政、?军事。?这就给了诸葛亮统辖军队的合法性，拥有了管辖益州地方部队的权力，涉足军事也变成了诸葛亮的分内之事了。
还有，诸葛亮开府治事，“开府”就是高级官员设立府署，?自辟僚属，?拥有独立的军事和行政权力。?诸葛亮开丞相府，这也就是为什么杨仪官职是丞相参军、我的官职是丞相主簿、马谡官职是丞相长史的原因，而后诸葛亮推行了宫府一体制，“宫中府中，俱为一体”。这样一般情况下，让相府的命令成为了皇帝的意见。
最后，诸葛亮锻炼新兵，治理军务，颇有经验和政绩。经历过大小战役无数，或出任军师（火烧博望坡），或参与军事外交（赤壁之战），或为指挥（收复零陵），或镇守一方（与关羽镇守荆州），或为援军（带队经涪陵入川）。诸葛亮前半段军事生涯的履历，也已经是很硬的了。
而反观李严在军中的威望，并不像赵云、魏延、吴懿那么高，甚至是同样是东州派的吴懿，也没有站队李严。
诸葛亮让李严坐镇永安，将护卫皇城、统辖禁军的职责给了自己的亲信向宠。就是出师表中提到“先帝称之曰能”的都督向宠，在率军南征之前，升向宠为中领军。这样保证成都的稳定，不会发生“高平陵之变”那种事情。
如此一来，李严的中都护形同虚设，李严一下子从“中央大员”成了“地方诸侯”。虽然仍然还有一定的势力，但已经完全不能和诸葛亮相比的了。
由此，也可以看出刘备对诸葛亮是绝对的信任。刘备一生阅人无数，他深知，李严肯定不是诸葛亮的对手。
刘备夺取西川之地后，致力于整合益州各派势力，但是还没做完，就被东吴背刺，征讨失败后，不久就去世了。他将李严任命为辅政大臣之一，也是对东州派的一些安抚。
托孤之臣中，二元结构的权力制度，是很危险的，魏国，魏明帝曹睿的托孤，仅让曹爽和司马懿一同辅政。结果，导致了“高平陵之变”。
刘备，作为一个一手打下三分江山的人，用李严来掣肘诸葛亮的可能性并不大。
归根结底，诸葛亮统辖了蜀汉的军权。而在军中威望是打出来的，只有一场场的胜仗，才能让诸葛亮军中的声望不断积累。