当最后一丝黑暗能量被吸入裂缝，"；星核之心"；突然发出震耳欲聋的嗡鸣。叶凡感到掌心的纹路被烫出金色轨迹，那是血脉中沉睡的古老契约，被激活的征兆。
"；快看窗外！"；林宇指着全息星图尖叫。
整个银河系正在经历不可思议的蜕变：扭曲的黑洞恢复成恒星育婴室，暗物质风暴化作璀璨的光带，就连最贫瘠的小行星带，都绽放出荧光植物。司马嫣然的防御炮台突然自动拆解重组，变成了漂浮的发光雕塑。
"；这是...宇宙重启？"；雷克斯的重剑在手中化为粒子流，却不痛不痒地落在地上。
空灵的声音再次响起，这次带着母性的温暖："；当你们选择用守护而非毁灭来使用力量时，就触发了最初的契约。现在，所有依靠战争能量生存的存在都将回归虚无。"；
叶凡突然明白那些机械生物为何总在重组——它们本就是宇宙自我修复的纳米机械，被反派篡改了程序。随着星核的净化，所有武器系统都开始逆向进化：能量炮开出量子玫瑰，战舰分解成生态舱，就连叶凡的佩剑都长出了藤蔓。
三个月后，重建的基地变成了星际科研站。司马嫣然的吧台里，全息投影循环播放着宇宙各处的和平景象：火星的孩子们在重力花园里放风筝，金星的机械水母与人类共舞，冥王星的冰雕艺术节上，雷克斯正在指导冰剑雕刻。
"；所以说，我们其实是宇宙的疫苗？"；林宇嚼着星际鱿鱼干，看着自己曾经的控制台变成了生态监测仪。
叶凡望着窗外正在自愈的超新星，感受着血脉中平和的律动："；不，我们只是通过了一场关乎宇宙命运的免疫测试。"；
远处，被改造成和平纪念碑的"；星核之心"；散发着柔和光芒，那些曾被黑暗能量侵蚀的星域，如今正绽放出比之前更绚丽的星云。而在某个更高维度的观测站里，无数光点欣慰地闪烁——这已是第782次成功的宇宙免疫实验。
然而，平静并没有持续太久。一天，叶凡在查看星系数据时发现一些异常波动。原本和谐共生的数据中，出现了一些错乱的代码痕迹。
众人紧急集合商议，怀疑是不是还有残留的黑暗势力在暗中作祟。林宇利用新型探测器深入探查，竟发现一种神秘的意识体，在悄悄吞噬新生的和平能量。
为了保卫来之不易的和平，他们决定再次出发。叶凡凭借着血脉中的特殊能力追踪意识体，雷克斯重新凝聚起，一把由光明能量构成的剑，司马嫣然则改造出一艘新型探索舰。
经过一番艰苦的搜寻，终于在一个，隐蔽的次元缝隙中，找到了意识体的源头。原来它是上次大战中，黑暗能量的怨念所化，企图破坏这刚刚修复的美好宇宙。众人齐心协力，以各自的力量，融合成一股强大的净化之力，将那股怨念彻底消除。
此后，宇宙真正进入了长久的繁荣时期，他们也成为了宇宙永远铭记的守护者。