深渊星域中，巨大的齿轮结构每转动一圈，宇宙的时空便扭曲一分。林羽的万象终焉剑被时空流体包裹，剑身上的混沌纹竟开始逆向流转，仿佛在遵循齿轮所制定的新规则。“这齿轮在重塑物理法则！”他奋力抽剑，却发现自己的动作与周围队友的动作产生了诡异的延迟，仿佛众人处于不同的时间流速中。
沈梦璃的协律中枢在齿轮的影响下，数据疯狂跳动。她发现全宇宙的量子网络正在被改写成齿轮状的拓扑结构，每个文明都成为了这巨大机械中的一个零件。“我们的科技、意识，甚至存在本身，都在被齿轮同化！”她紧急启动备用系统，试图保存文明的核心数据，却看到屏幕上弹出一行血色文字：“反抗即是徒劳，顺从方得新生。”
伊璇的永恒之树完全被黑色花朵覆盖，树灵的意识在混沌中发出最后的嘶吼：“齿轮的核心...是维度锚点...摧毁它...才能...”话音未落，树身轰然炸裂，化作无数黑色流光融入齿轮缝隙。伊璇的共生体剧烈震颤，她能清晰感受到宇宙的生命力正随着齿轮转动而流逝。
雷掣的机械生命体军团在维度裂缝中节节败退。那些由零件重组的敌人愈发强大，甚至能模拟出机械军团的终极武器。更可怕的是，部分机械体的核心开始出现自我意识，它们竟主动走进维度裂缝，声称要“拥抱真正的秩序”。“这些裂缝在吞噬我们的反抗意志！”雷掣的机械眼闪烁着红光，他将剩余军团改造成自爆模块，准备与裂缝同归于尽。
阿岚被困在意识空间的核心，银色面具的小女孩在她周围跳起诡异的舞蹈。每一个舞步落下，阿岚的混沌观测者形态就黯淡一分。“姐姐，你看这些文明多有趣，”小女孩摘下面具，黑洞般的眼眶中浮现出全宇宙的绝望，“他们总想打破规则，却不知道规则才是他们存在的意义。”阿岚试图反抗，却发现自己的精神力被禁锢在一个无限循环的逻辑陷阱中。
全宇宙文明联合议会陷入前所未有的混乱。议员们的身体开始机械异化，有的长出齿轮状的关节，有的化作数据流在会议室中穿梭。银河联邦的舰队在执行任务时，突然调转炮口对准母星，指挥官的通讯中传来齿轮转动的轰鸣：“这是宇宙的新秩序，我们都是齿轮的一部分。”三角座文明的科学家则疯狂大笑，将实验室改造成巨大的齿轮加工厂。
洛凛带领的新生守护者们在星学院顽强抵抗影兽。但影兽开始吸收守护者们的共生体能量，将其转化为扭曲的规则武器。一名学员在战斗中被影兽吞噬，再次出现时已成为银色面具的傀儡，用冷漠的声音说道：“反抗者，终将被碾碎。”洛凛的共生体也出现裂痕，他能感觉到自己的记忆正在被齿轮的规则改写。
林羽在时空乱流中艰难前行，偶然发现初代观测者遗留的全息日志。画面显示，远古时期曾有文明试图用齿轮结构统一宇宙规则，却导致维度失衡，引发了第一次宇宙大崩塌。“原来齿轮是毁灭的象征...”林羽握紧剑，突然注意到日志角落的一个细节——在齿轮停止转动的瞬间，出现了一道连接不同维度的金色裂缝。
沈梦璃在绝境中逆向破解齿轮的控制代码，发现其核心竟藏着全宇宙文明的“可能性锁”。每一个文明的未来都被预设了三种走向：被同化、被毁灭、成为齿轮的维护者。“这根本不是秩序，是文明的牢笼！”她将协律中枢与阿岚的意识连接，试图从精神层面找到突破点。
伊璇在永恒之树消散的地方，发现了一枚散发微光的种子。种子中传来树灵最后的意识：“用混沌...点燃希望...打破维度...”她将种子种在自己的共生体中，黑色的共生能量竟开始泛起金色的光芒。
雷掣的自爆行动意外撕裂了一处维度裂缝。透过裂缝，他看到齿轮的核心处有一个巨大的银色枢纽，枢纽周围缠绕着全宇宙文明的意识锁链。“那就是维度锚点！”他将机械军团的坐标共享给林羽，随后引爆所有能量核心，在裂缝中炸开一条通道。
阿岚在意识空间中与小女孩展开最终对决。她不再执着于打破逻辑陷阱，而是将混沌观测者形态化作无数可能性的碎片，渗入小女孩的意识网络。“真正的秩序，不是被规定的未来，”阿岚的声音在空间中回荡，“而是文明自由选择的权利！”小女孩的身体开始崩解，露出背后的齿轮核心。
林羽带领剩余守护者冲向维度锚点，万象终焉剑在混沌与希望的双重力量下重新绽放光芒。当剑刃刺入枢纽的瞬间，齿轮停止转动，宇宙的时空开始逆向回溯。但在一切恢复正常前，一个新的银色面具从裂缝中飘出，面具上浮现出全新的纹路——这预示着，更可怕的危机，正在未知的维度中悄然成型。