参天大树在归真殿的废墟上轻轻摇曳，五道传送门如同五片晶莹的叶子，在虚空中缓缓旋转。刘云轩站在最中间的传送门前，万物归真镜映照出剑冢深处的景象，万剑倒插如林，剑气凝结成霜，一枚青玉般的种子在剑阵中心沉浮。
刘云轩踏入门内，镜光护体，消失在流光中。苏婉选择了通往元素源泉的传送门，门后是魔法位面的核心，七彩元素如瀑布倾泻。林念源则走向科技宇宙的通道，量天尺上浮现出数据流般的星图。剩下的两道门，一道通向武道祖地，一道指向月宫本源，由青衣少女分身前往。
剑冢深处，刘云轩刚落地就感到刺骨剑意。无数古剑发出嗡鸣，剑气化作实质的锁链缠绕而来。万物归真镜悬在头顶，镜光过处，剑气锁链纷纷消融。但越往深处，剑意越强，到最后连镜光都开始波动。剑冢核心，那枚青玉种子被九把巨剑环绕。每把剑都代表一种剑道极致，天剑凌厉，地剑厚重，人剑通灵。九剑齐鸣，结成绝杀剑阵。更可怕的是，剑阵中浮现出一个白衣剑灵的虚影，容貌与刘云轩有七分相似。
剑灵的声音如同剑刃相击，说破阵者需接我九剑，接不住则道消魂灭。刘云轩不言，药锄点地。锄尖触地的刹那，整个剑冢的剑气突然静止。他不是硬接，而是引导，药锄划过玄奥轨迹，竟将九剑剑气引向彼此。天剑对地剑，人剑斩心剑，九剑相克，阵势自破。剑灵怔住，身形渐渐消散，说以柔克刚，方为剑道真谛。青玉种子落入刘云轩手中，种子内部竟有微型剑阵流转。
元素源泉处，苏婉遭遇更大危机。七彩元素瀑布突然倒卷，化作七个元素巨人围攻。创世印记全力运转，却难以调和暴走的元素。危急时刻，她福至心灵，将印记投入瀑布源头。印记与本源交融的刹那，她看到了元素平衡的终极奥秘，不是压制，而是共鸣。七个巨人突然停手，化作七色光点融入她眉心。一枚七彩种子在瀑布中心浮现，种子表面流转着元素生克的永恒韵律。
科技宇宙核心，林念源面对的是逻辑绝境。整个宇宙的法则正在崩溃，因果链断裂，时间线紊乱。量天尺测量出的每个结果都自相矛盾。他放弃测量，转而观察崩溃本身，发现所有混乱都指向一个奇点，那里悬浮着一枚水晶种子。当他伸手触碰种子时，整个宇宙的崩溃突然停止。原来种子不是要被拯救，而是要在崩溃中完成蜕变。新生的法则从种子中萌芽，比旧法则更加完美。
武道祖地和月宫本源处，青衣少女的两道分身也各遇机缘。武道种子在血脉长河中沉浮，需要以战意唤醒；月宫种子藏在本源星核内，需用镜光接引。就在五枚种子即将集齐时，异变突生。五个世界的天空同时裂开，五只巨手抓向种子。这些手的主人，正是当初抢夺种子的神秘势力。更可怕的是，他们的目标不是种子本身，而是要通过种子污染归真本源。
刘云轩镜光护种，感受到巨手中熟悉的虚无气息。苏婉创世印记剧震，发现元素种子被暗影侵蚀。林念源量天尺预警，测算出这是调虎离山之计，真正危险在归真大树。五道传送门突然关闭，众人被强行拉回大树之下。只见树干上那只眼睛已经完全睁开，眼中映照出的，是五枚种子被污染的未来图景。
就在这千钧一发之际，刘云轩突然将五枚种子抛向空中。种子并非散开，而是组成一个玄妙的五行阵型。青玉种子代表木，七彩种子代表火，水晶种子代表水，武道种子代表金，月宫种子代表土。五行相生，形成一个完美的循环。
阵型成型的刹那，五道纯净的本源之力从种子中涌出，交织成一道光网，将五只巨手牢牢束缚。巨手在光网中发出痛苦的嘶吼，渐渐消散成虚无。但危机并未解除，树干上的眼睛突然流下血泪，血泪所落之处，大树开始枯萎。
苏婉创世印记绽放，试图治愈大树，却发现枯萎来自内部。林念源量天尺测量树心，发现树心处有一个漆黑的空洞，空洞中散发着与虚无之主同源的气息。青衣少女脸色惨白，说原来归真大树早已被侵蚀，我们取回种子的行为，反而加速了它的崩溃。
刘云轩万物归真镜照向树心，镜光过处，浮现出一个被遗忘的真相：归真大树本是镇压虚无的最终屏障，但漫长岁月中，虚无之力早已渗透树心。五枚种子不仅是文明精华，更是加固封印的关键。如今种子离位，封印即将彻底瓦解。
就在这时，五枚种子突然发出共鸣，挣脱刘云轩的控制，自动飞向树心的空洞。每枚种子落入空洞，大树就恢复一分生机。当最后一枚种子归位时，树心空洞完全愈合，树干上的眼睛也缓缓闭合。
但就在众人松口气时，大树突然剧烈震动。树冠上结出的那枚果实裂开，里面坐着一个婴儿大小的树人。树人睁开双眼，眼中没有瞳孔，只有无尽的星空。它开口说话，声音苍老而威严：封印完成，但代价是五界将失去文明本源。若不及时归还种子，那五个世界将退回混沌状态。
刘云轩三人面面相觑，没想到成功加固封印的代价如此巨大。此刻他们面临艰难抉择：是保住归真大树，还是拯救五个世界。就在这时，青衣少女突然指向远方：你们看。
只见五个世界的方向，各升起一道光柱。光柱中，那些世界的生灵正在自发献出自己的文明感悟，化作替代种子的能量。修真剑修们献出剑道领悟，魔法师们献出元素理解，科学家献出知识结晶...无数文明精华跨越虚空，汇入归真大树。
树人婴儿露出微笑，说这就是归真之道的真谛：文明因共享而永恒。随着文明精华的注入，五枚种子自动从树心飞出，回归各自世界。而归真大树不仅没有衰弱，反而因为吸收了更丰富的文明养分，长得更加茂盛。
但就在一切圆满解决时，树冠顶端突然传来碎裂声。那枚象征未来的果实彻底裂开，里面空无一物。树人婴儿叹息道：最大的危机还未到来。果实预示的未来，已经消失了。