接到朱温宽恕并将功折罪的命令，原本惶惶不可终日的朱珍如同打了鸡血，立刻抖擞精神，点齐早已在濮州待命多时的两万大军，气势汹汹直扑兖州治所——曲阜。
这里需赘述一下：大顺元年（890年）朱温与朱瑾兄弟争夺兖郓，攻克原治所瑕丘后，为泄愤竟将那座古城付之一炬。战后设置泰宁军节度使，因瑕丘残破，新任节度使朱珍便强行将治所迁至曲阜。他不仅霸占了曲阜城，还将孔氏族人驱离故宅，在曲阜城外围筑一座“罗城”作为节度使官署及驻军之地，而将内城（曲阜老城）留给地方官及百姓，实则将整个曲阜地区变成了一个大军营。如今，这座被朱珍改造过的坚城，反而成了敌人抵御他的堡垒。
当朱珍率领大军抵达曲阜时，已是乾宁二年（895年）的仲夏。距离刘鄩奇袭夺取此地，已过去近两个月。这两个月的时间至关重要。刘鄩凭借其过人的手腕和兖州本地人对朱温的普遍仇视，成功安抚人心，并迅速扩军。在“保卫乡梓、反抗暴梁”的号召下，大量青壮加入，军队规模膨胀至近万人。尽管其中大半是新募之卒，实战经验匮乏，但守卫家园的士气却异常高昂，他们熟悉城防，同仇敌忾。
朱珍一路急行，轻装简从，并未携带重型攻城器械。眼见曲阜城垣高厚（朱珍之前建的坚固，搬起石头砸了自己的脚），他只得按下急切心情，在城外择地安营扎寨，同时派出大量士兵和强征来的民夫，四处砍伐林木，就地打造云梯、橹盾和简易的攻城锤。
朱珍此人，勇武善战不用说，但同样性情暴戾，行事往往不择手段。在寻找优质木材时，他那贪婪而缺乏敬畏的目光，投向了曲阜城北的孔林——孔子及其后裔的家族墓地，古柏参天，林木蓊郁。
“都给老子砍了！这些木头正好做云梯！”朱珍马鞭一指，毫无顾忌。
麾下士兵如狼似虎般冲入圣域，斧锯齐施，千年古木在刺耳的声响中纷纷倒地，巍峨的孔林瞬间被毁大半，满地狼藉。留守孔林的孔氏族人闻讯赶来，悲愤交加，上前理论，却被朱珍的亲兵粗暴推开，几位族老甚至挨了几个响亮的耳光，被斥为“通敌刁民”。
消息传到曲阜罗城（此时被刘鄩作为指挥中心），孔家主事人孔胄气得浑身发抖，在城头指着朱珍军营方向破口大骂：“朱珍匹夫！汝毁我先圣陵寝，亵渎文脉，人神共愤，必不得好死！” 声音凄厉，闻者无不动容。
朱珍在营中听闻，只是狞笑：“圣人？能挡老子攻城否？现在尔等是逆贼，休要聒噪！”
如此折腾了半个多月，所需的简易攻城器械总算凑齐。朱珍迫不及待，下令全军猛攻曲阜。战鼓擂响，梁军士兵顶着盾牌，推着云梯、冲车，如同潮水般涌向城墙。
然而，攻城战进行得极不顺利。其一，曲阜城墙本就高大坚固，易守难攻。其二，朱珍仓促打造的器械十分粗糙，云梯强度不足，攻城锤也难以撼动加固过的城门。其三，也是最重要的一点，守城的刘鄩堪称这个时代的守城名将！他调度有方，将新老兵卒混合使用，以老带新。滚木礌石、烧开的金汁、弓弩箭矢，被精准而高效地倾泻到攻城敌军头上。梁军几次看似即将突破城头，都被刘鄩亲率预备队及时堵住缺口，血战击退。
战事陷入了残酷的拉锯。朱珍焦躁不已，每日驱赶士兵轮番猛攻，城下尸积如山，但曲阜城依旧岿然不动。时间一天天过去，转眼又是半个月。
就在这时，来自汴州梁王行营的严厉斥责文书送到了朱珍手中。原来，朱温已亲率主力大军抵达徐州前线，与吴王钱镠亲自督战的大军形成了对峙。东方战局的核心已然转移至徐州，朱温本以为朱珍早该拿下空虚的兖州，侧击郓州，甚至威胁沂州，从而牵制钱镠和王师范的联军。万万没想到，朱珍竟连一个主要由新兵防守的兖州都迟迟攻不下来！
文书之中，朱温的怒火几乎要透纸而出，将朱珍骂得狗血淋头，指责其无能至极，贻误战机，严令其必须限期攻克兖州。
朱珍又羞又急，攻势愈发疯狂，但除了增加己方伤亡外，毫无进展。终于，朱温失去了最后的耐心。一道新的命令传来：解除朱珍兖州方向的指挥权，其所部一万多人留驻原地，牵制刘鄩。改派头号大将葛从周，统一指挥进攻兖州、郓州战事！