坐在国家计委宽大的办公室里，林瀚面对的已不再是特区或广东一隅的具体项目，而是铺满整张桌子的全国性数据报表、区域发展规划图和各部委报送的战略建议稿。他的视野，必须覆盖960万平方公里的土地，思考必须穿透眼前，直达十年、二十年后的未来。
他所负责管理的两个重要部门——长期发展规划司高技术产业司，乃是整个计委系统中的关键所在，承担着至关重要的核心业务职能。针对这两个司内的工作人员，他提出了一项极为严格且全面性极高的要求：他们必须具备广泛而深入的知识储备，既需要精通经济学领域的各种理论及实践应用技巧；同时也得熟悉科技创新相关方面的最新动态以及前沿趋势；此外还需了解社会学层面上的各类问题及其解决方案；最后但同样不可忽视的一点则在于掌握一定程度的国际关系学常识并能灵活运用到实际工作当中去应对复杂多变的国际政治环境。
在首次召集全体司局级干部参加的内部会议时，他便以一种斩钉截铁地口吻明确指出：所谓的发展规划绝非简单意义上地玩弄一堆枯燥乏味的数据就能敷衍了事那么简单！它实际上更像是一份关乎于一个国家未来前途命运走向的宏观蓝图绘制计划或者说战略部署方案制定工程。因此我们每个人都应当对此有足够清醒深刻的认识才行啊！
他亲自带队，用三个月时间，密集调研了东北老工业基地、中部农业大省、西部生态脆弱区以及长三角、京津冀等主要经济圈。调研不是走马观花，而是深入一线，与工人、农民、企业家、基层干部面对面交流，掌握了大量第一手情况。
经过一番深入地实地考察与研究之后，他对于当下中国经济所面临的各种结构性矛盾有了更为透彻且全面的认知——地区之间的发展严重不均衡；城市和乡村呈现出明显的二元化特征；整个国家的产业布局极不科学合理；本土企业缺乏足够强大的自主研发及科技创新实力；而日益严峻的生态环境状况也给社会经济的可持续健康稳定增长带来了前所未有的巨大压力......诸如此类的一系列棘手难题，其复杂程度以及影响深度都远远超出了他当初在广东省工作期间所目睹过的那些情况。
在向计委党组和国务院领导提交的调研报告中，他系统阐述了这些挑战，并明确指出：“过去依靠要素投入和规模扩张的增长模式已经难以为继，必须尽快转向依靠科技创新、提高全要素生产率的集约化发展道路。‘十五’计划，必须成为这一转型的开端。”
他的报告，以其翔实的数据、深刻的分析和前瞻的视野，引起了高层领导的高度重视。他也因此被委以更重要的任务——牵头起草 《“十五”计划纲要（草案）》 中关于“产业结构优化升级”和“实施科教兴国战略”的核心部分。
这意味着，他将有机会亲手将自己的理念，融入国家未来五年的发展蓝图之中。