太初有墟，混沌如卵。中有巨木，根扎无底幽冥，枝探无垠虚廓，名曰“建元”。其根所盘，结为“大千世界”，星云如髓，流转其间，一星一界，法度森严；其干所贯，衍化“中千世界”，山河悬缀枝桠，光气为川，灵脉作岭；其梢垂露，露中孕“小千世界”，微尘含刹土，浮沫载众生。三界本一气，建木通其玄。
小千世界有岛名“蜉蝣”，浮于无量海。岛民朝生暮死，寿不过三日。然其族敏慧，以露筑城，以雾织锦，临终刻毕生所知于贝叶，沉入海底“忆川”。有少年玄微，独异于众，尝见深海有巨目开阖，疑为天神。是日大雾弥天，海涌黑潮，岛基震动，穹顶现蛛网裂痕——此乃小千世界崩解之兆！玄微坠海，恍惚见建木根须如黑龙垂降，卷其入虚空漩涡。
及醒，身已在“中千世界”的“万象山”。此界光怪陆离：山脉为巨兽脊骨所化，河流乃星辰泪滴汇成。空中浮岛三千，各据一“小千世界”如掌上明珠。玄微立足处，正是建木分枝“天脐”，光络如星河脐带，连接诸浮岛。忽闻雷霆裂空，万象山主峰“须弥顶”迸发浊气，光络寸断！诸浮岛如断珠坠落，岛中小千世界尽化飞灰。玄微被气浪掀飞，幸为建木气根所缠，得见骇人真相：须弥顶裂口内，赫然伸出覆盖鳞甲的巨爪——竟有域外天魔，噬穿界壁，自大千世界破入！
“蝼蚁安敢窥天机？”魔音贯脑，玄微几近魂飞。千钧一发，一道素影掠至，挥袖拂散魔音。来者乃此界镇守“璇玑仙子”，玉面凝霜：“建木灵根被污，天魔借道噬界。汝身负小千界残存气运，或可通灵根本源，随我来！”素手引其踏光脉疾驰，身后山峦崩裂，天魔巨爪过处，万象皆腐。
至建木主干“通玄柱”下，柱体浊斑蔓延，光络枯萎。璇玑结印引星辰之力灌柱，浊斑稍退复涌。仙子唇角溢血：“天魔蚀根已深，非大千‘星髓’不能净…”话音未落，巨爪撕天而至，指缝滴落粘稠魔涎，触地即生污秽妖物！璇玑推开玄微，以身化剑迎上，清光与魔爪碰撞，天地失色！
玄微被气浪抛入通玄柱裂缝。柱内别有乾坤：光脉如巨树经络，流淌金液。循脉行，渐闻搏动之声若宇宙胎息。至心核处，惊见光液浑浊如脓，一颗“建木灵种”悬于中央，本应晶莹剔透，现却缠满漆黑魔纹！灵种搏动间，魔纹如活蛇游走，将清源染作秽流——此即三界病变之源！
“小千蜉蝣，竟至此地？”阴影中现出天魔本相：人面蛛身，八目赤红，“建木吸尽大千星髓，吾界枯竭万载！今噬其灵种，三界重归混沌，方是正道！”口吐秽言，魔纹暴长，灵种骤暗！玄微怀中小千界遗贝“忆川贝叶”忽放清光，光中浮现蜉蝣先祖刻痕：“刹那即永恒”。福至心灵，玄微引贝叶清光点向灵种魔纹。光纹相触，竟现蜉蝣岛民三日一生：朝采雾露，午筑城池，暮刻贝叶…生生不息之念力，如星火灼烧魔纹！
天魔厉啸，魔爪透柱而入！当此际，璇玑仙子残魂忽凝于玄微身侧：“借汝身为桥，引大千星髓！”其魂化光桥，一端连玄微心窍，一端直贯九霄！玄微五内如焚，神念沿光桥飙升，冲破中千天穹，直抵大千世界！
大千景象，浩瀚无极。然星辰尽成灰白，银河干涸如巨尸脉管。中央“归墟”内，天魔本体——一颗搏动的“熵寂之心”正吞噬最后星光。玄微神念至，万星残骸竟生感应，齐发悲鸣！归墟深处，一点星髓精粹受其牵引，如萤火破夜，顺光桥逆流而下！
光桥另一端，天魔之爪已扼住玄微咽喉。熵寂之心在归墟狂笑：“星髓早绝，汝引何物…”笑声戛然！那点星髓精粹，穿越光桥注入建木灵种！霎时灵种清光大爆，如青阳初升！缠绕的魔纹寸寸断裂，污浊光脉顷刻澄澈！天魔之爪在清光中熔解，熵寂之心剧震：“不可能！星髓已…”
“星髓从未绝！”玄微长啸，忆川贝叶中蜉蝣众生念力喷薄而出，与大千残星共鸣。归墟内，万星残骸齐放微光，虽弱犹存！星骸微光汇入星髓精粹，光潮沿建木奔腾！所过之处，小千世界露珠重凝，中千山河污浊尽褪。熵寂之心在光潮冲击下，如热汤沃雪，尖啸消融！
三界渐苏，然建木通体裂痕遍布。玄微神魂将散之际，璇玑仙子最后意念响起：“灵种需新主…” 未及回应，其身已化清流融入灵种。灵种得此献祭，骤然收缩为芥子，复又暴涨！旧建木轰然崩解，新木自光海中抽枝——根须扎入重凝的大千星云，枝干贯通新生的中千世界，梢头垂露如雨，每一滴皆孕小千世界。露珠光影流转间，偶现蜉蝣岛民刻贝身影；中千光脉里，璇玑舞剑残影依稀；大千星河深处，熵寂之心残骸化作滋养新木的星尘。
自此，三界无主亦有序。大千星辰明灭，若建木呼吸；中千山川移位，如木理延展；小千众生生死，似叶露轮回。时有行者见建木新干上隐现少年形影，抚枝微笑，指间星尘洒落，化入无量小千世界。劫波渡尽，方知三界本是一树荣枯。
异史氏曰：观此三界劫波，始知大小之辩本属虚妄。大千星髓将竭，反借小千蜉蝣三日之念重燃；天魔视众生如草芥，终亡于芥子灵光。玄微以蜉蝣之身承三界之重，非其力伟也，乃因建木本根，原系万灵共生之气脉。最玄妙处，在劫尽新生时，木朽而种活，种破而树生——此中轮回，恰似小千露珠映大千星河，刹那生灭里，自有亘古不易之天机。嗟乎！世尊说三千大千世界，岂在疆域广狭？实乃一念起时，露珠可纳星海；迷障蔽处，宇宙亦成囚笼。新木参天，非为标榜伟迹，但向众生证此本心平等、三界同春耳。